במהלך שנת 2016 בוצע שדרוג למסועים המשנעים את הבוצה ממכונות סחיטת הבוצה אל סככת המכולות. מערך המסועים מהווה צוואר בקבוק והשבתתו תגרום להשבתת מערך מכונות לסחיטת בוצה, ולהשבתת הטיפול בבוצה במכון הטיהור. השדרוג כלל ייצור של מערכות הנעה חדשות למסועים עם מיקום חדש למיסבים המאפשר גישה נוחה לביצוע עבודות אחזקה. שדרוג זהה בוצע למערכת המותחנים של סרטי המסוע. כמו כן הוחלפו הסרטים במסועים והותקנו ממסרות חדשות ותופים חדשים. נבנה לוח בקרה חדש למסועים המאפשר למפעיל בשטח להגיב מהר יותר לתקלות. קיימת יתירות במערך המסועים שמאפשרת שינוע הבוצה גם כאשר ישנה תקלה באחד המסועים.